SSH指定校一覧 各校のHPにリンクしています
| 平成14～16年度 指定 | 平成15～17年度 指定 | 平成16～18年度 指定 | ||||||
| 都道府県 | 学校種 | 学校名 | 都道府県 | 学校種 | 学校名 | 都道府県 | 学校種 | 学校名 |
| 北海道 | 道立 | 札幌北 | 北海道 | 道立 | 帯広柏葉 | 福島県 | 県立 | 相馬 |
| 宮城県 | 県立 | 第一女子 | 岩手県 | 県立 | 水沢 | 埼玉県 | 県立 | 浦和第一女子 |
| 山形県 | 県立 | 米沢興譲館 | 秋田県 | 県立 | 大館鳳鳴 | 千葉県 | 県立 | 柏 |
| 福島県 | 県立 | 安積 | 茨城県 | 県立 | 竹園 | 千葉県 | 私立 | 芝浦工業大学柏 |
| 群馬県 | 県立 | 高崎 | 栃木県 | 県立 | 宇都宮 | 東京都 | 都立 | 戸山 |
| 埼玉県 | 私立 | 早稲田大学本庄 | 群馬県 | 県立 | 高崎女子 | 東京都 | 私立 | 東海大学付属高輪台 |
| 千葉県 | 市立 | 千葉市立千葉 | 神奈川県 | 私立 | 慶應義塾 | 石川県 | 県立 | 七尾 |
| 東京都 | 国立 | 筑波大学附属駒場 | 新潟県 | 県立 | 新潟南 | 福井県 | 県立 | 藤島 |
| 東京都 | 国立 | 東京工業大学工学部附属工業 | 富山県 | 県立 | 高岡 | 山梨県 | 県立 | 甲府南 |
| 神奈川県 | 県立 | 柏陽 | 石川県 | 県立 | 金沢泉丘 | 岐阜県 | 県立 | 恵那 |
| 新潟県 | 県立 | 長岡 | 福井県 | 県立 | 高志 | 静岡県 | 県立 | 清水東 |
| 富山県 | 県立 | 富山 | 長野県 | 県立 | 屋代 | 三重県 | 県立 | 松阪 |
| 長野県 | 県立 | 諏訪清陵 | 岐阜県 | 県立 | 岐山 | 滋賀県 | 県立 | 彦根東 |
| 愛知県 | 県立 | 岡崎 | 静岡県 | 県立 | 磐田南 | 京都府 | 府立 | 洛北 |
| 京都府 | 国立 | 京都教育大学附属 | 愛知県 | 県立 | 一宮 | 大阪府 | 府立 | 天王寺 |
| 京都府 | 私立 | 立命館 | 三重県 | 県立 | 四日市 | 兵庫県 | 県立 | 神戸 |
| 京都府 | 市立 | 堀川 | 和歌山県 | 県立 | 桐蔭 | 奈良県 | 県立 | 奈良 |
| 大阪府 | 府立 | 北野 | 鳥取県 | 県立 | 鳥取東 | 和歌山 県 | 県立 | 海南 |
| 兵庫県 | 県立 | 姫路工業大学附属 | 島根県 | 県立 | 松江東 | 島根県 | 県立 | 益田 |
| 奈良県 | 私立 | 西大和学園 | 広島県 | 国立 | 広島大学附属 | 山口県 | 県立 | 山口 |
| 岡山県 | 県立 | 岡山一宮 | 山口県 | 県立 | 岩国 | |||
| 広島県 | 県立 | 広島国泰寺 | 徳島県 | 県立 | 城南 | |||
| 愛媛県 | 県立 | 松山南 | 香川県 | 県立 | 三本松 | |||
| 高知県 | 県立 | 高知小津 | 長崎県 | 県立 | 諫早 | |||
| 福岡県 | 県立 | 修猷館 | 熊本県 | 県立 | 第二 | |||
| 沖縄県 | 県立 | 開邦 | 宮崎県 | 県立 | 宮崎北 | |||